Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH12Q96NR8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms