Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF560Q96MR9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms