Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG1Q96JA1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms