Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms