Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNFT2Q96EX2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms