Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGF29Q96ES7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGF29Q96ES7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms