Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms