Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM44Q96DX7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms