Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NXNL1Q96CM4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms