Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms