Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREML1Q86YW5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREML1Q86YW5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms