Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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