Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms