Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HECW1Q76N89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms