Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms