Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM88Q6PEY1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms