Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms