Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms