Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms