Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTBL2Q562R1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTBL2Q562R1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms