Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms