Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTLL9Q3SXZ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms