Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms