Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms