Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX1AQ16623 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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