Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TNXAQ16473 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNXAQ16473 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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