Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CNGA3Q16281 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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