Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
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