Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM25Q14258 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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