Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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