Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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