Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms