Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms