Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3EP60228 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms