Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms