Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPT1P50897 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPT1P50897 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPT1P50897 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPT1P50897 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPT1P50897 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPT1P50897 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPT1P50897 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPT1P50897 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms