Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPFP49454 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPFP49454 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms