Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNBP48739 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms