Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPR4P46093 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPR4P46093 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPR4P46093 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPR4P46093 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPR4P46093 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPR4P46093 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPR4P46093 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms