Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP5P45974 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP5P45974 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP5P45974 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP5P45974 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP5P45974 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP5P45974 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP5P45974 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP5P45974 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms