Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETV4P43268 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETV4P43268 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETV4P43268 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETV4P43268 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETV4P43268 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETV4P43268 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETV4P43268 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETV4P43268 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV4P43268 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV4P43268 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETV4P43268 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms