Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCAMP43121 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCAMP43121 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCAMP43121 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCAMP43121 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCAMP43121 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms