Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP2P42575 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP2P42575 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP2P42575 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP2P42575 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms