Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPGP40121 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPGP40121 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPGP40121 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPGP40121 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms