Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKACBP22694 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms