Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYL1P12980 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LYL1P12980 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYL1P12980 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYL1P12980 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYL1P12980 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYL1P12980 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms