Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA3P0C7M3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms