Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms