Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFNA21P01568 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFNA21P01568 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFNA21P01568 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms