Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNTO95613 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNTO95613 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNTO95613 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNTO95613 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNTO95613 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms